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肿瘤结构变异 5% ctDNA标准品

货号 单位规格 库存 浓度
GW-OCTM001 0.5 μg/支 9999 20 ng/µL
  • 简介
相比组织检测，液体活检方便，快速，即时，便宜，微创的特点，使其迅速成为目前肿瘤基因检测甚至是肿瘤早筛的研究热门。然而，由于DNA片段小，半衰期短，低丰度，肿瘤治疗过程中含量逐渐减少，正常细胞DNA污染，不同检测方法等一系列因素的限制，结果准确性没有统一标准。
菁良科技的ctDNA标准品适用于液体活检各过程：从文库制备，变异检测，到信息分析；同时适用于各检测方法：NGS 测序，PCR 检测等。
肿瘤结构变异 5% ctDNA标准品主要用于 ctDNA 样本复杂结构变异的检测。这个标准品高度模拟了临床样本，包含8个经过 ddPCR 验证的拷贝数变异/扩增，易位和大片段插入/缺失，高/低GC区域内变异，可以用来验证您的分子和生物信息学流程。
  • 产品信息
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浓度 20 ng/µL
保存溶剂 Tris-EDTA (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0
存储温度 2-8˚C
保质期 36个月
规格 0.5 μg/支
检测项目 检测方法 质量标准
等位基因突变频率/基因型 微滴式数字PCR AF=0%,可接受范围 ≤0.1% AF＜1%,可接受误差范围 = ±50%(0.1%位点检测到的AF值必须比对应野生型位点高至少0.05%) 1%≤AF＜5%,可接受误差范围 = ±40% 5%≤AF＜10%,可接受误差范围 = ±30% 10%≤AF,可接受误差范围 = ±20% 拷贝数＜5,可接受误差范围 = ±40% 5≤拷贝数＜10,可接受误差范围 = ±30%
片段分布 4150 TapeStation System 片段平均长度160bp±10%
浓度 Qubit® 4.0 Fluorometer 20 ng/µL±15%
序号 突变类型 基因位点 CDS突变 突变频率/拷贝数 COSMIC编号 (COSMIC v96) 染色体编号 染色体位置（GRCh38）
1 SNV AKT1 E17K c.49G＞A 5% COSM33765 14 104780214
2 SNV PIK3CA E545K c.1633G＞A 5% COSM763 3 179218303
3 Insertion EGFR A767_V769dup c.2300_2308dup 5% COSM12376 7 55181317-55181318
4 Deletion EGFR E746_A750del c.2235_2249del15 5% COSM6223 7 55174772-55174786
5 Fusion CD74(6)-ROS1(34) CD74(6)-ROS1(34) 5% COSF1200 6,5 117324415,150404680
6 Fusion EML4(6)-ALK(20) EML4(6)-ALK(20) 5% COSF474 2,2 42264951,29223528
7 CNV MET Amplification NA 3.5 copies NA 7 116672196-116798386
8 CNV ERBB2 Amplification NA 7.0 copies NA 17 39687914-39730426
  • 评估检测流程的效率
  • 评估背景噪声对变异检测的影响
  • 验证生物信息学流程的稳健性
  • 优化和验证新的癌症panels，并监测流程性能
  • 探测流程的监测限和定量限
  • 分析检测流程的灵敏度，准确度和特异性
  • 比较各平台的检测差异

以下文件命名格式为产品货号-产品批次号-产品文件类型

GW-OCTM001-202103001- 数字PCR实测值： 下载
GW-OCTM001-202112061-COA： 下载
SMS-GW-OCTM001-A1 产品说明书： 下载
GW-OCTM001-202103001-COA： 下载
GW-OCTM001-202112061-数字PCR实测值： 下载
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货号：
GW-OGTM001
格式：
肿瘤